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HOLMES ssRNA reporter (FAM)
| 貨號 | 31111 | 售價(元) | 1000 |
| 規(guī)格 | 1 OD powder | CAS號 |
- 產(chǎn)品簡介
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產(chǎn)品描述
HOLMES-Fluo ssRNA reporter 1(FAM)是單鏈RNA寡核苷酸探針,5′端標記FAM熒光報告基團(Reporter),3′端標記熒光淬滅基團(Quencher)。當HOLMES ssRNA reporter探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號會被淬滅基團淬滅。而當HOLMES ssRNA reporter探針被切斷后,5'端的FAM熒光報告基團和淬滅基團分離,從而發(fā)出可被檢測的熒光信號。常見的Cas13酶在與guide RNA、target RNA組成三元復合物后,都會被激發(fā)出針對ssRNA的反式剪切活性(或稱為旁路切割活性),將HOLMES ssRNA reporter探針切碎,并發(fā)出熒光信號。
HOLMES-Fluo ssRNA reporter 1(FAM)探針經(jīng)過特別的序列優(yōu)化,對Cas13反式切割活性高度敏感,可作為Cas13家族蛋白反式切割反應(yīng)的報告探針;同時Cas12家族的各種蛋白對該探針也有不同程度的反式剪切活性;因此,該探針能廣泛用于CRISPR/Cas13或CRISPR/Cas12反應(yīng)體系,但不適合用于雙系統(tǒng)檢測。
實驗流程
1.反式剪切實驗體系
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組分 |
體積 |
終濃度 |
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10 × HOLMES Buffer for Cas13 |
2 μL |
1 × |
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10 µM Cas13 Nuclease |
0.05~0.5 μL |
25~250 nM |
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10 µM guide RNA |
0.05~0.5 μL |
25~250 nM |
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10 µM Target RNA |
0.05~0.5 μL |
25~250 nM |
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10 µM HOLMES-Fluo ssRNA reporter 1(FAM) |
0.05~0.5 μL |
25~250 nM |
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Nuclease-free water |
Up to 20 μL |
◆ 反式剪切體系中各組分的用量可以根據(jù)不同的實驗?zāi)康倪M行調(diào)整,用量較少時可先將各組分稀釋后加入體系;
◆ 建議使用低吸附的離心管、吸頭等耗材;
◆ 反式剪切體系中探針的用量和預期反應(yīng)到達平臺期的時間可參考各批號Cas酶transU的具體數(shù)值,詳見本公司提供的COA檢測報告。
實時熒光定量PCR儀檢測熒光信號,每30 sec采集一次熒光信號,反應(yīng)溫度根據(jù)不同的Cas13酶最適溫度進行設(shè)定。
產(chǎn)品組分
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組分 |
31111 |
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1 OD |
a.HOLMES-Fluo ssRNA reporter 1(FAM)總量為1 OD (約為9.29 nmol),為干粉狀態(tài)。使用前請先短暫離心,然后加入92.9 µL DNase/RNase-Free Water溶解,得到濃度為100 µM的貯存液,在無反復凍融的條件下可于-80℃避光保存6~12個月。使用前再將貯存液用DNase/RNase-Free Water稀釋成10 µM的工作液,按下表推薦的濃度加入CRISPR剪切反應(yīng)體系中。剩余工作液可于-20℃避光保存,3~6個月內(nèi)使用。
保存條件
-20℃避光儲存;≦4℃運輸。