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WB內(nèi)參抗體選擇指南

內(nèi)參是什么？

內(nèi)參是一種特異識別高表達或普遍表達蛋白的抗體，在western blot中用于校正蛋白水平。

什么情況下需要用內(nèi)參抗體?
1. 定量比較：對比不同點樣孔間信號的時候，內(nèi)參是必須的。只有各孔間內(nèi)參的表達量相同，目標蛋白表達量的變化才是可信的。
2. 上樣和轉(zhuǎn)移確認：內(nèi)參可以確認是否所有的樣品都加入及各孔間的轉(zhuǎn)移量是否相等。通過分析內(nèi)參信號可以確定蛋白從膠轉(zhuǎn)移到膜上是否均一。
3. 研究發(fā)表：大部分雜志要求做WB實驗時提供內(nèi)參數(shù)據(jù)，來確保實驗樣本中差異表達量是可信的。內(nèi)參可以校正各孔間目的蛋白的表達量。

在內(nèi)參抗體的選擇過程中一般遵循以下原則：

首先要考慮的就是實驗樣本來源于什么物種。
1、哺乳動物的組織或者細胞樣本，通常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Histone H3、Na,K -ATPase等。
2、植物來源實驗樣本，則可以選擇plant actin、Rubisco等。
3、其他來源樣本研究較少，所以就應該參照文獻報導，選擇合適的蛋白作為內(nèi)參。

蛋白分子量
選擇內(nèi)參抗體時，應該考慮目的蛋白分子量的大小。通常應該保證目的蛋白與內(nèi)參蛋白分子量相差5KD以上。比如目的蛋白分子45KD，此時不適宜選擇β-actin作為內(nèi)參，可以考慮選擇GAPDH或者β-tubulin作為內(nèi)參。

目的蛋白表達部位
就一般的蛋白檢測來說，β-actin、β-Tubulin抗體等就可以了，而針對于核蛋白的定量，特別是樣本蛋白就是核蛋白時，選擇恰當?shù)暮说鞍變?nèi)參則更能體現(xiàn)內(nèi)部參照的價值。
常用的核內(nèi)參抗體有Lamin A、Lamin B、Histone H3，除此之外，其它常見的核蛋白內(nèi)參還有PCNA、K70、K80等，在一些文獻報道中，Erk2、TATA binding protein(TBP)以及c-Jun、c-Fos等都有使用。
而對于膜蛋白檢測，常用的內(nèi)參抗體為Na,K ATPase。
對于線粒體蛋白的檢測，常用VDAC1和COX IV作為內(nèi)參抗體。
以上幾條原則只是針對通常情況，但是需要注意的問題是——內(nèi)參的選擇需要考慮實際的實驗環(huán)境。
比如某些細胞中，由于組織缺氧、糖尿病等因素會導致GAPDH的表達增高，不適合做內(nèi)參。
比如在涉及細胞增殖相關試驗中，c-Jun由于自身表達變化就不適合做內(nèi)參;而在凋亡實驗時，TBP、Lamin等也不適合作為內(nèi)參。
因此設計實驗方案的時候應該考慮這些因素并查詢相應文獻，在實驗過程中也應該注意如果內(nèi)參表達出現(xiàn)異常，應考慮這方面因素。

常見內(nèi)參：

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